护法运动从一开始就把希望寄托在西南各省的“有力者”，即一批地方军阀身上。而这些军阀只不过利用中山先生和太炎先生等声望，与北方军阀讨价还价而已。太炎先生以秘书长的身份，风尘仆仆，往返于滇、黔、川、鄂各省之间，联络“有力者”参加护法。
 

后又受命为中山先生的总代表，渡南海，取道越南，赴昆明，劝说云南军阀唐继尧接受军政府元帅印章，共同护法。在这期间，他与中山先生不断书电往来，讨论护法方略，他努力贯彻中山先生意图，竭尽全力，劝说群阀出兵护法。但是，任凭他唇焦舌敝。