在神秘主义的指导下，雄黄的应用方式也显得颇为玄幻，比如将它佩戴在身上就能辟邪：“雄黄能杀百毒，辟百邪，杀蛊毒。人佩之，鬼神不敢近;入山林，虎野狼伏;涉川水，毒物不敢伤。”“以雄黄带头上，或以枣许系左腋下，终身不魇。”在家洒雄黄水也能驱邪，而且不能有一丁点阴气沾染：“用真雄黄三钱，水一碗，以东南桃枝咒洒满屋，则绝迹。勿令妇女见知。”
 

但雄黄并没有从一开始就成为端午节的驱邪上品。明代之前端午节驱邪所用的药物，主要是菖蒲、兰和艾。这些芳香草药本身有一定的消毒防疫作用，因而也有了驱瘟能力的附会。《荆楚岁时记》载：“五月五日。谓之浴兰节。四民并蹋百草之戏。采艾以为人。悬门户上。以禳毒气。以菖蒲或镂或屑以泛酒。”